泥鰍對食物的要求不十分挑剔，水中的泥沙、殖質、有機碎屑都是其食物，攝食的餌料生物種類有:硅藻類、綠藻類、藍藻類、裸藻類、黃藻類、原生動物類、枝角類、撓足類和輪蟲等。泥鰍在全長為3 一 5 厘米時，喜食腐殖質，其次為小型甲殼動物、昆蟲等，胃腸食物團中，泥沙和腐殖質的重量比例高達70 ％左右，生物餌料的重量只占 30 ％。全長5 一 8 厘米時喜食水中浮游動物、絲蚯蚓等，偶爾也食藻類、有機碎屑和水草的嫩葉與芽等。當全長8 一 10 厘米時，食性偏雜，主食大型浮游動物、碎屑、藻類和高等水生植物的根、莖、葉、種子，也食部分微生物。生活在不同水體的泥鰍，其食物組成有所不同。有研究人員做不同水體的泥鰍食性觀察，發現稻田、池塘排水溝和污水溝的泥鰍腸道中的食物成分各有不同。
泥鰍在稻田中以攝食介形蟲、劍水蚤、尖額溞為主，以攝食水綿為輔，偶爾攝食其他一些水生動物。這說明泥鰍在稻田中是攝食水生動物為主，水生植物為輔的雜食性魚類。
泥鰍在池塘的排水溝中主要攝食彎尾溞、尖額溞、劍水蚤、介形蟲、盤腸溞及其他小型甲殼動物和水生昆蟲，兼食雙星藻，是典型的雜食性魚類。
泥鰍在不同水體的不同生態環境條件下，其食物各有一些差異，但可以認定其是偏動物食性的雜食性魚類，主食昆蟲幼蟲、小型甲殼動物、藻類及高等植物。環境中食物的易得性及喜好性是影響泥鰍食物組成的重要原因。自然界中泥鰍喜食動物型活餌料有以下兩個原因:一是活餌料易感知；二是適口性好。通過觀察發現，泥鰍攝食水生昆蟲時并不是主動向目標移動，而是當昆蟲游至泥鰍觸須感知的范圍內激起水波，泥鰍感知后，才突然前沖，將昆蟲吞入口中。因此，泥鰍的攝食方式是半主動的方式。另外，泥鰍的食物組成表明，其對環境條件的適應能力較強，在動植物餌料均缺乏的情況下，也能攝食有機碎屑和活性淤泥來維持其能量供應。因此可以認為，泥鰍不僅能適應水質惡劣的環境，而且還可以攝食多種餌料以維持其生長。
在人工養殖條件下，可以利用施肥培養生物餌料來喂養幼鰍；培育成鰍可投喂螺螄、蚯蚓、蠶蛹粉、河蚌肉及禽畜內臟等肉食類飼料，并搭配一定比例價格較低廉的植物飼料，如米糠、麩皮、豆渣、三等面粉及老菜葉、棄置的瓜果類等。泥鰍與其他魚類混養，則可以食魚類的糞便、殘渣剩餌，所以泥鰍被稱做池塘中的清潔工。
泥鰍無論是攝食天然飼料，還是攝食人工飼料，都表現出對動物性飼料有明顯的喜食性。由于泥鰍的食性雜，所攝取的餌料來源廣且又豐富，對泥鰍的快速生長，產量較高起十分重要的作用。